بجانب ما تمنحه إضافة الفلفل الملون للطعام من شكل جمالي وطعم رائع، فإنه في المقابل تتعدد فوائده الصحية، فيعد مصدرا هاما للعديد من المعادن الهامة للجسم مثل البوتاسيوم والمنجنيز والثيامين و الموليبينيوم والنحاس والزنك، كما يحتوى على مجموعة فيتامينات "ب"  ( ب 1 ، ب2 ، ب3 ، ب5 ، ب6 ، ب9 )، كما يحتوي على نسب عالية من الألياف ومضادات الأكسدة، وفيما يلي نستعرض أهم الفوائد الصحية للفلفل الملون:

-يدمر الخلايا السرطانيّة التي تعتبر أساساً للإصابة بمرض السرطان بأنواعه المختلفة.

-يحتوي  الفلفل الأحمر والأصفر على نسبة مضاعفة من فيتامين "ج" مما يجعله فعال في منع الإصابة بجلطات الدم و السكتات الدماغية.  

- يحفز إنتاج الخلايا البيضاء ما يعمل على الحماية من العديد من الأمراض المعدية.

- يخفض نسبة  الكولسترول الضار في الجسم.

- ينظم درجة حرارة الجسم لاحتوائه على نسب كبيرة من المغنسيوم.

- يحتوي  على نسبة جيدة من الألياف التي تكافح الإمساك.

- غني بعنصر  البوتاسيوم والذى يساعد على خفض ضغط الدم المرتفع.  

- يساعد في منع مشاكل الجهاز التنفسي مثل الربو وإلتهاب الرئة.   

- يعمل على  تعزيز بطانة الأغشية المخاطية للأنف ما يحمي من الإصابة بنزيف الأنف.

- يحمي من ظهور  علامات الشيخوخة وذلك لمحتواه العالى من مضادات الأكسدة.