تقول د. شيماء صابر أبو عجاج استشاري أمراض المناعة: قد تحدث قرح الفم وجود مشاكل في الفم والأسنان، أو تناول أكلات معينة كالحمضيات والأطعمة الحارة كالشطة، وتعد أيضا علامة لوجود مرض مناعي كالذئبة الحمراء أو مرض بهجت أو أمراض مناعية أخرى، وفي الحالة الأخيرة تكون القرح متكررة بشكل كبير بدون سبب واضح و يصاحبها جفاف بالفم والعين وأعراض أخرى.