حصلت كلية الطب بالقوات المسلحة على الاعتماد المؤسسي من الهيئة القومية لضمان جودة التعليم والاعتماد، عقب استيفائها كافة الشروط والمحددات اللازمة للحصول على ذلك الاعتماد، وذلك فى إطار حرص القوات المسلحة على تطبيق أعلى معايير الجودة بمختلف المنشآت التعليمية العسكرية.
وقد سبق هذا الاعتماد حصول الكلية على شهادة الاعتماد البرامجي واعتماد جميع برامجها الدراسية في المجالات الطبية المختلفة.
وتسعى كلية الطب بالقوات المسلحة على مواكبة التطور العلمي المتلاحق في مختلف مراحل المنظومة التعليمية لإعداد أجيال جديدة من الأطباء المتسلحين بكل ما هو جديد في المجالات الطبية التخصصية المختلفة وبما يسهم في تقديم خدمة طبية متميزة للعسكريين والمدنيين على حد سواء.