طلب الرئيس الراحل محمد أنور السادات عقد جلسة استثنائية لمجلس الشعب لتكريم أبطال حرب أكتوبر، وكانت قد أعدت قائمة بأسماء المكرمين وعلى رأسهم وزير الحربية أحمد إسماعيل واللواء أحمد بدوي والفريق أول محمد عبد الغني الجمسي واللواء بحري فؤاد ذكري واللواء محمد على فهمي والمقدم باقي زكي يوسف واللواء محمد حسني مبارك  واللواء فؤاد عزيز غالي وأيضاً لاسم الشهيد طيار عاطف السادات.

أقيمت الجلسة الاستثنائية في 19 فبراير 1974 وحضرها قادة حرب أكتوبر والمكرمون وأسر الشهداء، وكان ضمن الحضور ضيف مصر العقيد معمر القذافي والرئيس الزائيري جوزيف موبوتو، وقام الرئيس السادات بتكريم أبطال حرب أكتوبر وتم منح المقدم باقي زكي يوسف نوط الجمهورية العسكري من الطبقة الأولى وقلده الرئيس السادات بنفسه النوط ، تكريماً وتقديراً لفكرته التي كانت بادرة ونافذة النصر بحرب أكتوبر، ولدوره في قيادة سلاح المركبات والذي اهتم بصيانة وإصلاح أعطال المركبات أثناء الحرب، كما تسلم الرئيس السادات وسام نجمة سيناء تكريماً لاسم شقيقه الطيار عاطف السادات وقام بتسليمه الوسام وزير الحربية أحمد إسماعيل.

تم تشييع جثمان اللواء باقي زكي يوسف اليوم من كنيسة مارمرقس بشارع كليوباترا بمصر الجديدة ، وسيظل اسمه خالداً في التاريخ بجميل أفكاره وأعماله بالقوات المسلحة المصرية.