وقع الرئيس عبد الفتاح السيسي قانون رقم ١٠ لسنة ٢٠٢٠ بتنظيم هيئة المتحف المصري للحضارة المصرية.
وتتكون أجهزة المتحف - وفقا للقانون المنشور في الجريدة الرسمية - من مجلس الأمناء ومجلس الإدارة والرئيس التنفيذي، ويكون لهيئة المتحف مجلس أمناء برئاسة رئيس الجمهورية وعدد من الأعضاء لا يزيد على عشرين عضواً ويختص مجلس الأمناء بإقرار السياسة العامة والخطط اللازمة لهيئة المتحف، ويصدر بتشكيل مجلس الأمناء ومدة عضويته وتنظيم عمله قرار من رئيس الجمهورية.