شكلت وزارة الأوقاف، لجنة مشتركة، بالتعاون مع المجلس الأعلى للشئون الإسلامية لمواجهة الفكر المتطرف. 

تتكون اللجنة برئاسة أمين عام المجلس الأعلى للشئون الإسلامية، وعضوية كل من : 

1- رئيس القطاع الديني ويكون مقررًا للجنة ومتحدثًا باسمها .

2- رئيس قطاع المديريات                                                                                  عضوًا .

3- وكيل الوزارة لشئون المساجد والقرآن الكريم                                                                    عضوًا.

4- وكيل الوزارة لشئون الدعوة عضوًا وأمينًا لسر اللجنة .

وتكون مهمتها :

1- وضع الخطط العلمية والعملية لمواجهة الفكر المتطرف ، ومتابعة تنفيذها .

2- سرعة اتخاذ اللازم تجاه كل من يثبت تبنيه أو دعمه للفكر المتطرف                      أو الجماعات المتطرفة من العاملين بالأوقاف .

3- سرعة اتخاذ اللازم تجاه كل من يرتكب عملاً مخلا بالشرف أو المروءة                   أو الخروج على القيم من أي من المنتسبين للأوقاف .

وتكون اللجنة في حالة انعقاد دائم  ، ولها أن تستعين بمن ترى في سبيل تنفيذ مهامها ، ومقرها بالمجلس الأعلى للشئون الإسلامية .