وضعت وزارة البيئة بالتنسيق مع عدد من الوزارة خطة طوارىء وطنية لمواجهة حوادث تلوث نهر النيل، لوضع الأسس الوطنية للإستعداد ومواجهة حوادث التلوث وتقليل الأضرار السلبية الناتجة منها على النيل، تحت مظلة جهاز شئون البيئة وتفعيل جميع الجهات التى لها مهام ومسئولية في تقديم الدعم والمساعدات اللازمة أثناء حوادث الجسيمة، طبقاً لمفهوم مستويات المكافحة.
وفى التقرير التالى نرصد 9 توصيات فى الخطة للمحافظة على نهر النيل من التلوث..
1- عدم إلقاء المخلفات بجميع أنواعها في مجرى نهر النيل.
2- تخصيص أماكن للتخلص من المخلفات بجميع أنواعها ووضعها فى الحاويات الخاصة بذلك على طول ضفاف نهر النيل.
3- رفع الوعى البيئى لدى المواطنيين من خلال تنظيم ندوات توعية، لطلاب المدارس والجامعات مما يزيد روح الحفاظ على نهر النيل وتقديس قيمته كشريان للحياة.
4- عمل نشرات اعلامية بواسطة الهيئات والجهات المختصة "الرى والزراعة والبيئة"، للتوعية بأهمية الحفاظ على نهر النيل.
5- معاقبة رادعة وتفعيل القوانيين لمعاقبة الأشخاص والجهات التى تتسبب فى تلوث مياه مجرى نهر النيل بأى وسيلة.
6- تطوير وسائل الرى لتخفيض نسبة المياه المفقودة .
7- البحث عن موارد إضافية للمياه كإقامة السدود في المناطق التى تتساقط فيها الأمطار .
8- تقليص مساحات المحاصيل التى تحتاج إلى كميات كبيرة من مياه نهر النيل.
9- تقنين استخدام الأسمدة والمبيدات بكثرة في المحاصيل الزراعية.