نفت وزارة التربية والتعليم والتعليم الفني وجود أى صلة لها بما تم نشره على المواقع الإلكترونية ومواقع التواصل الاجتماعي بالحديث عن المدارس اليابانية، وما تضمنه من معلومات وبيانات أو تقديم تدريبات لأي من المعلمين بخصوص هذه المدارس.
وأشار بيان للوزارة إلى أن الجهة الوحيدة المنوطة بالتعامل مع هذه المدارس هي موقع الوزارة الإلكتروني http://www.moe.gov.eg/ ، ووحدة مشروع المدارس اليابانية في الوزارة (الصفحة الرسمية للمدارس المصرية اليابانية -ejs) على صفحة الفيس بوك الرسمية للمشروع.