تعد مكتبة جوانينا التابعة لجامعة كويمبرا ألتا وصوفيا واحدة من مكتبتين برتغاليتين لإيواء مستعمرات الخفافيش كرادع طبيعي للحشرات التي كانت تتغذى على الكتب والمخطوطات القديمة.

ووفقًا لتقرير نشرته صحيفة "نيويورك تايمز" الأميركية فمن غير المعتاد وجود مستعمرة من خفافيش pipistrelle الشائعة التي تعيش خلف أرفف الكتب في واحدة من أجمل المكتبات في العالم، يقسم أمناء هذه الأعجوبة التاريخية أن القوارض الطائرة تقدم خدمة لا غنى عنها، فهي تتغذى على الحشرات التي من شأنها أن تلحق الضرر أو تتغذى على الكتب القديمة.

وبما أن بعض هذه المخطوطات القديمة لا تقدر بثمن فعليًا، فلا عجب أن الخفافيش تعتبر أوصياء متعاونين هناك العديد من أنواع الحشرات المعروفة بقضمها على الورق، وتشكل خطرًا كبيرًا على المكتبات مثل جوانينا.

لحسن الحظ، تعمل الخفافيش التي تسمي هذا المكان بالمنزل كشكل من أشكال المكافحة الطبيعية للآفات، إنها ليلية، لذا فهي لا تزعج زوار المكتبة أثناء النهار، ولكن بمجرد غروب الشمس، تبدأ في الخروج من خلف أكشاك الكتب القديمة وتلتقط الحشرات مباشرة قبل الخروج من المبنى عبر النوافذ المفتوحة.

لا أحد يعرف متى انتقلت مستعمرة الخفافيش الشائعة إلى مكتبة جوانينا، لكن يعتقد الكثيرون أنها كانت موجودة منذ افتتاحها، منذ مئات السنين، يمكن إرجاع سجلات وجودهم هنا إلى القرن التاسع عشر على الأقل.

تعتبر الخفافيش الصغيرة في مكتبة Joanina من عوامل الجذب الشهيرة، ولكن ما يثير فضول معظم الناس دائمًا هو ما يحدث مع كل الفضلات التي تتركها الخفافيش عادةً، هذا شيء كانت المكتبة تتعامل معه منذ قرون.

كل مساء، يتم تغطية الأثاث الأصلي من القرن الثامن عشر بجلود الحيوانات، وفي الصباح، يتم تنظيف الأرضيات من قبل طاقم التنظيف، تعتبر الفوضى التي يتسببون فيها ثمناً زهيداً لدفع ثمن الخدمة التي يقدمونها.

نظرًا لأن الخفافيش ليلية ، فمن الصعب على الزائرين التقاط  صور لها أثناء زيارتهم لجوانينا ليبراي ، لكن البعض يقول إن الانتظار على الدرجات المؤدية من المكتبة إلى الساحة المرصوفة بالحصى القريبة في أي ليلة معينة لا بد أن ترى القوارض الطيران من المبنى أو العودة إليه.