تمثل بطولة السوبر المصرى لنادى الزمالك معضلة من صعب حلها على مدار الـ15 سنة الأخيرة.

وشارك النادى فى 7 نسخ لبطولة السوبر المصرى فاز ببطولتين منهاـ وخسر في 5 مشاركات، منها 4 أمام النادي الأهلى.

وافتتح الفارس الأبيض البطولة بالفوز على غزل المحلة فى النسخة الأولى عام 2001، وفاز فى الثانية على المقاولون العرب عام 2002، وكانت هى البطولة الثانية والأخيرة له،

وانهزم الزمالك فى المباراة الثالثة أمام الأهلى 1 /3 بضربات الترجيح عام 2003، كما انهزم فى الرابعة أمام المقاولون العرب 2 /4 فى عام 2004.

وفى النسخة الثامنة للبطولة تعرض الزمالك لهزيمة جديدة أمام الأهلي بنتيجة 2- 0 عام 2008، ومرة أخرى بضربات الترجيح بنتيجة 5/4 فى عام 2014، وفى النسخة الأخيرة فاز الأهلى بنتيجة 3-2 فى الإمارات.