شرب القهوة مع بعض الأدوية قد يسبب تفاعلات خطيرة مثل زيادة ضغط الدم، ضعف امتصاص الدواء أو تعزيز الآثار الجانبية، وأهم الأدوية التي يجب الحذر منها تشمل أدوية الغدة الدرقية والربو والسكري وبعض المضادات الحيوية ومسكنات الألم الشائعة، حيث يشير الدكتور محمد كمال أخصائي الأمراض الباطنة أسباب تعارض القهوة مع بعض الأدوية وهي: الكافيين يعمل كمنبه قوي يزيد من نشاط الجهاز العصبي. يمكن أن تضعف امتصاص بعض الأدوية أو يغير سرعة وصولها للدم. قد يؤدي إلى زيادة الآثار الجانبية مثل الأرق، الصداع، أو اضطراب ضربات القلب. وهذه قائمة بأهم الأدوية التي لا ينصح بتناولها مع القهوة: أدوية الغدة الدرقية تقلل القهوة من امتصاص الدواء وتضعف فعاليته. الجمع مع الكافيين وأدوية الربو يزيد سرعة ضربات القلب والأرق. بعض أدوية تنظيم السكر قد تؤثر القهوة على مستويات السكر وتضعف التحكم. حيث أن القهوة تبطئ تكسير المضادات الحيوية وتزيد تركيزها في الدم. الكافيين يعزز امتصاص مسكنات الألم ويزيد فعاليتها لكنه قد يضاعف الآثار الجانبية. مضادات الإكتئاب قد تزيد القهوة من القلق والأرق وتضعف التوازن الكيميائي.