نقص فيتامين B12 يمكن أن يُلاحظ عبر مجموعة من المؤشرات حتى قبل إجراء التحليل، لكنها لا تكفي للتشخيص المؤكد، ويشير الدكتور أحمد عطية أخصائي الأمراض الباطنة إلى أن هذه العلامات تنبه فقط إلى احتمال وجود النقص، وهي كالتالي: تعب وإرهاق مستمر حتى مع النوم الكافي،شحوب أو اصفرار الجلد نتيجة فقر الدم، ضعف الشهية وفقدان الوزن، ألم أو التهاب في اللسان مع تقرحات في الفم،مشاكل هضمية مثل الإسهال أو الإمساك،وخز أو تنميل في اليدين والقدمين بسبب اعتلال الأعصاب الطرفية. كذلك ضعف العضلات وصعوبة الحركة،مشاكل في التوازن والتنسيق الحركي و ضعف الذاكرة وصعوبة التركيز. أيضا الاكتئاب وتقلبات الحالة النفسية والعصبية و تشوش ذهني أو ضعف الإدراك.