يوضح الدكتور نصر نصار إستشارى أمراض النساء والتوليد والعقم أنه لا يوجد علاج دائم لبطانة الرحم المهاجرة، ولكن يمكن للأطباء تقديم بعض أنواع العلاج التي بدورها تساعد في العلاج ويعتمد العثور على العلاج المناسب على العديد من العوامل المختلفة، بما في ذلك عمرالسيدة والأعراض التى تعانى منها، أكثر علاجات بطانة الرحم المهاجرة إنتشارا والتي لا تتطلب جراحة هي العلاج الهرموني وإدارة الألم. تتأثر أنسجة بطانة الرحم بالهرمونات بنفس طريقة تأثر أنسجة بطانة الرحم داخل الرحم، ويمكن أن تؤدي التغيرات الهرمونية التي تحدث مع فترة الحيض إلى تفاقم ألم بطانة الرحم المهاجرة. ويمكن أن تغير العلاجات التي تشمل العلاج بالهرمونات مستويات الهرمونات أو تمنع الجسم من إنتاج هرمونات معينة، ويمكن أن يؤثر العلاج الهرموني على القدرة على الحمل، لذلك قد لا يكون مناسبا لجميع السيدات. يمكن تناول العلاج الهرموني على شكل أقراص أو حقن * العلاج من خلال إستئصال الرحم: وهو إجراء جراحي لإزالة الرحم قد يلجأ إليه الأطباء كخيار لعلاج بطانة الرحم المهاجرة، وقد يوصي طبيبك المعالج أيضا بإزالة المبيضين (استئصال المبيض) مع أو بدون استئصال الرحم. وسيوقف هذا إفراز الهرمونات ويجب أن يعالج بطانة الرحم المهاجرة نهائيا، لكنه سيضعك في سن اليأس. ويؤدي إزالة المبيضين إلى خفض مستويات هرمون الأستروجين بشكل كبير وإبطاء أو إيقاف نمو أنسجة بطانة الرحم، لكنه يأتي مع المخاطر والآثار الجانبية لانقطاع الحيض، بما في ذلك أمراض القلب، ومشاكل الذاكرة، والاكتئاب أو القلق.