يقول الدكتور رضا الوكيل استاذ الجهاز الهضمي والكبد ان تشخيص الإصابة بجرثومة المعده يتم عن طريق المنظار بأخذ عينة من الغشاء المخاطي المبطن بجدار المعدة ثم توضع هذه العينة على شريحة في قالب به ماده جيلاتينية، هذه المادة بها مادة اخرى تساعد على اكتشاف مايسمى بالامونيا فاذا تغير اللون الى الاحمر فهذا يعني وجود الامونيا وبالتالي هذا دليل على وجود ميكروب جرثومة المعدة بنسبه 95%.