يحذرنا دكتور أحمد لطفي أستاذ المناظير والجهاز الهضمي بطب عين شمس من مضاعفات الارتجاع ويعتبر أكبر خطر هو الإهمال وهذا ينطبق علي أي مرض وبالنسبة للارتجاع لو لم يكتشف ويعالج جيداً ويتطور إلي التهاب أسفل المريء، ويصل الأمر لحدوث تقرحات فيحدث ضيق في المريء، مما يسبب صعوبة في البلع أو تتكون خلايا سرطانية، لذا نقول إن أهم أسباب سرطان المريء وجود ارتجاع وعدم علاجه جيداً. وبعض المرضي الذين وصلوا لالتهابات شديدة يجب أن نقوم بإجراء جراحة بالمنظار لهم، وقد نحتاج لعمل صمام صناعي بدل الصمام الأصلي وهي عملية دقيقة ، ولكن يتم إجراؤها بالمنظار.