أوضحت الدكتورة نهى اسماعيل أخصائى الباطنة والحميات أن علاج ألم فم المعدة يختلف بحسب السبب ،فإذا كان السبب عسر الهضم فإن العلاج يكون بتقليل كمية الطعام واختيار أنواع معينة من الأطعمة ،واذا كان السبب الارتجاع المريئي فإن تناول أدوية مثل مضادات الحموضة التى يحددها الطبيب هى الحل بينما إذا كانت القرحة الهضمية هى السبب فإن الأدوية قد تشمل مضادات الحموضة وأدوية خاصة لعلاج الالتهابات.