يعتمد الكيتو دايت على تناول كميات كبيرة من الدهون وتناول نسبة قليلة من الكربوهيدرات، بالإضافة إلى إنخفاض تناول الخضروات والفواكه والحبوب، وهو أمر مضر جدًا بالصحة، حيث أن اتباع الكيتو دايت يؤدي إلى إضرار الكلى بالإضافة إلى أنه يؤدي إلى ظهور أعراض ما يسمى بأنفلونزا الكيتو، مثل التعب الشديد والدوخة والغثيان والشعور بالصداع والإمساك الشديد، وتشير الدكتورة هند يوسف أخصائية التغذية العلاجية إلى الآثار الجانبية السلبية الذي يسببها هذا الرجيم، وهي كالتالي: يؤدي إلى إجهاد الكلى، وذلك لكثرة تناول الأطعمة الحيوانية عالية الدهون والتي هي أساس نظام الكيتو دايت. يؤدي إلى زيادة خطر الإصابة بحصوات الكلى، لذا لا ينصح باتباع هذا الرجيم إلا بعد استشارة الطبيب. لا ينصح باتباعه إذا كنت مصاباً بمرض السكر من النوع الأول أو الثاني، حيث يمكن أن يؤدي إلى حالة خطيرة تسمى الحمضية الكيتونية الذي يحدث عندما يخزن الجسم الكثير من الأحماض المنتجة وهذا يؤدي إلى زيادة حمضية الدم جداً. من أضرار الكيتو دايت على الكلى أيضاً أنه يؤدي إلى تفاقم أمراض الكلى المزمنة، وذلك لأنه يسبب زيادة حمضية الدم والبول.