تقول الدكتورة لبني الشباسي استشاري الطب النفسي أنه أحيانًا يكون الضغط النفسي أو المشكلات النفسية هي السبب في مشكلة عسر الهضم، ولأنّ عسر الهضم المزمن يمكن أن يؤثر على نوعية حياة الفرد، قد يوصي الطبيب ببعض الإجراءات التي تُساعد على تحسين الحالة النفسية، وتقليل القلق والتوتر، وبالتالي  تخفيف أعراض عسر الهضم، وأهم هذه الطرق: الخضوع للعلاج المعرفي السلوكي. ممارسة تقنيات التأمل والاسترخاء. العلاج بالكلام. تناول مضادات الاكتئاب، فقد يوصي الطبيب بتناولها فترة قصيرة وبجرعات منخفضة لعلاج عسر الهضم المرتبط بالاكتئاب أو القلق، خاصة أن بعض الأدوية المستخدمة في تعديل المزاج تعمل بطريقة مشابهة للأدوية التي تؤثر على أعصاب المعدة.