تشرح دكتورة كريمة يوسف أستاذ الجهاز الهضمي أنه تظل الجرثومة في جدار المعدة، وهذا الجدار الذي به ثلاث طبقات قد تصيب الجدار الأول وقد تتغلغل للطبقة الثانية أو الثالثة وهذا يفسر عدم ظهورها في تحليل البراز لو أصابت الطبقة الأولي فقط لذا فمنظار المعدة هو أفضل الطرق لاكتشاف جرثومة المعدة.