يشير د. أيمن تعلب استشاري الجهاز الهضمي والكبد، لمضاعفات إهمال علاج فتق الحجاب الحاجز حيث قد يؤدي هذا إلى ارتجاع في المعدة مزمن، ألم بالصدر وضيق بالتنفس، و مشاكل بالقلب، وكذلك نزيف أو أنيميا نتيجة تآكل جدار المريء بسبب الحمض، مع صعوبة في البلع بسبب التهابات أو ضيق بالمريء.