يقول الدكتور محمد عبد العظيم استشاري الباطنة أنه يمكن أن ينجم نقص فيتامين د عن سوء امتصاصه من الأمعاء، ومن الأسباب الصحية التي تؤدي إلى قلة امتصاص فيتامين دال من الأمعاء متلازمة الأمعاء القصيرة،الداء البطني،أمراض الأمعاء الالتهابية، مثل مرض كرون. وأيضا التليف الكيسي،قصور البنكرياس المزمن،إجراء عملية استئصال الأمعاء الدقيقة أو تحويل مسار المعدة.