قالت الدكتورة داليا فاروق أخصائي طب الفم والأسنان أن علاج متلازمة الفم الحارق يعتمد على الأعراض الظاهرة لدى المريض وحدتها أو المشكلة الصحية التي ربما سببت ألم الفم ومن المهم استخدام بعض العلاجات التي قد تساعد على تحفيز إنتاج اللعاب وعلاج جفاف الفم. وأضافت داليا كما يجب تناول المكملات الغذائية لسد أي نقص حاصل في بعض العناصر الغذائية، مثل: الزنك، وفيتامينات المجموعة ب، والحديد. وتابعت فاروق وفي بعض الحالات نستخدم بعض المراهم الموضعية لتسكين الألم ،و يتم تناول بعض أنواع الأدوية المخصصة لعلاج الاكتئاب أو القلق ، أو قد نحتاج تغيير الأدوية التي يتناولها المريض إذا ما كانت هذه الأدوية هي سبب ألم الفم.