يعتبر تناول الليمون والكمون آمناً ولا يوجد ضرر من استعماله، إلا في حالات محددة والتي يشير لها الصيدلي د. عمرو عبدالحكيم، الإصابة بقرحة المعدة ومشاكل في الأمعاء، لأنه قد يسبب تهيج المعدة ومشاكل في الهضم، ينصح بعدم تناول الكمون قبل العمليات الجراحية، لأنه يخفض مستوى سكر الدم بشكل كبير، يجب على المرأة الحامل والمرضع استشارة الطبيب قبل تناوله، لأنه يؤثر على إدرار الحليب، يفضل عدم تناول الأطفال مشروب الليمون والكمون، لأنه يسبب لهم تهيج الأمعاء.