تقول الدكتورة سالي عبد الله استشاري التغذية أنه تعزز البطاطا المشوية صحة الجهاز الهضمي لغناها بالألياف، إذ تحتوي 100 غرام منها على 2.2 غرام ألياف، كما قد لا تسبب هذه الألياف أي مشاكل للمصابين بمتلازمة القولون العصبي، ولذلك تعتبر خياراً جيداً لهم. ويعتبر تعزيز نمو البكتيريا النافعة في الأمعاء من أبرز فوائد البطاطا المشوية، وذلك لأن النشا المقاوم فيها يتحول في الأمعاء  الغليظة إلى أحماض دهنية قصيرة السلسلة ومن أهما البيوتيرات الذي يعتبر الغذاء المفضل للبكتيريا النافعة. ومن أهم فوائد البيوتيرات التي تم إثباتها مخبرياً هي تخفيف أعراض مرض كرون، والتهاب القولون التقرحي، والتهاب الرتج وذلك لأنه يخفف الالتهاب في الأمعاء، ومن المحتمل أنه يقلل خطر الإصابة بسرطان القولون.